IPC memiliki 12 Cabang Pelabuhan yang tersebar di 10 wilayah Indonesia yang beroperasi menangani berbagai aktivitas kepelabuhanan. Berikut adalah nama nama Cabang Pelabuhan dibawah naungan IPC:
DKI Jakarta
Banten
Lampung
Sumatera Selatan
Kalimantan Barat
Sumatera Barat
Jawa Barat
Bengkulu
Jambi
Bangka Belitung
DKI Jakarta
Bangka Belitung